Milán, 2 de julio de 2024 – Combatiendo futuras pandemias a través del análisis de datos de genomas virales recombinantes. Un estudio publicado en la prestigiosa revista Nature Communication presenta los prometedores resultados de RecombinHunt, un nuevo método basado en datos desarrollado por el Departamento de Electrónica, Información e Ingeniería Biológica del Politécnico de Milán y la Universidad de Milán, que puede identificar, con alta precisión y eficiencia computacional, genomas recombinantes del SARS-CoV-2 con uno o dos puntos de ruptura.
La recombinación, es decir, la composición de dos o más genomas virales para formar un nuevo genoma, es un mecanismo molecular eficiente para la evolución y adaptación de los virus.
Aprovechando el incentivo de la pandemia de COVID-19, se han propuesto varios métodos para detectar genomas recombinantes del virus SARS-CoV-2; sin embargo, hasta ahora, ninguno ha podido confirmar fielmente los análisis manuales de los expertos en el campo.
ReconbinHunt muestra alta especificidad y sensibilidad, es más efectivo que todos los demás métodos ya desarrollados, y confirma fielmente los análisis manuales de expertos.
El método, desarrollado bajo el proyecto PRIN PNRR 2022, SENSIBLE (Sistema de advertencia temprana de datos pequeños para patógenos virales en salud pública), también identifica genomas virales recombinantes de la reciente epidemia de viruela del mono con alta concordancia con los análisis manualmente curados por expertos, lo que sugiere que el enfoque es robusto y puede ser aplicado a cualquier virus epidémico o pandémico, representando una herramienta importante para combatir futuras pandemias.
Prof. Stefano Ceri señala que “la investigación fue posible gracias a la extraordinaria contribución de laboratorios de todo el mundo, que pusieron a disposición de la comunidad internacional más de 15 millones de secuencias virales”. Dra. Anna Bernasconi, líder del proyecto SENSIBLE, señala: “Nuestro objetivo es construir herramientas de advertencia para anticipar y combatir nuevas epidemias y pandemias virales”.
“El estudio demuestra cómo el desarrollo de métodos computacionales innovadores y eficientes nos permite apreciar con mayor precisión y rigor la evolución de los patógenos y cualquier implicación para la salud humana”, agrega Prof. Matteo Chiara, profesor de Biología Molecular en la Universidad de Milán y co-líder del proyecto SENSIBLE.
Una contribución principal al estudio fue dada por el Dr. Tommaso Alfonsi, quien recientemente obtuvo un doctorado “cum laude” en Ingeniería de la Información, presentando esta y otras investigaciones oportunas.
Revista
Naturaleza
Método de investigación
Estudio experimental
Asunto de investigación
Células
Título del artículo
Detección de recombinación impulsada por datos en genomas virales
Fecha de publicación del artículo
17-abr-2024
