El Motor de Búsqueda de Genomas Hortícolas (HSE) introduce una herramienta innovadora que transforma la exploración de la genética de los cultivos hortícolas. Al permitir el acceso rápido y el análisis de datos de más de 500 especies de plantas, HSE mejora nuestra capacidad para decodificar complejas redes genéticas. Este lanzamiento marca un avance fundamental en los estudios hortícolas, ofreciendo información detallada sobre la genética de los cultivos, fundamental para la nutrición y la salud humanas.
A medida que la genómica redefine profundamente nuestra comprensión de los cultivos hortícolas, los investigadores a menudo se enfrentan a datos genómicos dispersos y complejos. Esta fragmentación dificulta significativamente el análisis y la aplicación efectivos, presentando una clara demanda de herramientas de investigación más cohesivas. Abordar esta necesidad es crucial para desbloquear todo el potencial de las ideas genómicas para mejorar la calidad, la diversidad y la resiliencia de los cultivos frente a las crecientes demandas agrícolas.
Investigadores de la Universidad Agrícola de Beijing, en colaboración con científicos internacionales, han anunciado el desarrollo del Motor de Búsqueda de Genomas Hortícolas (HSE), publicado en la prestigiosa revista Horticulture Research el 8 de abril de 2024. El estudio (DOI: 10.1093/hr/uhae100) introduce un nuevo motor de búsqueda diseñado para consultar y analizar datos genómicos de más de 500 cultivos hortícolas, mejorando nuestra comprensión de las funciones de los genes y la mejora de los cultivos.
HSE consolida datos genómicos de una amplia gama de más de 500 cultivos hortícolas en una plataforma unificada, proporcionando un acceso fácil y una comparación eficiente de la información genética. Equipado con herramientas avanzadas como Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) y Synteny Viewer, HSE agiliza los procesos de consulta de genes y anotación funcional. Funciones como las interfaces de consulta por lotes y el análisis de enriquecimiento simplifican la navegación de datos, mejorando la eficiencia de la investigación. La capacidad del motor para identificar familias de genes cruciales, como los factores de transcripción TCP en los tomates, destaca su papel esencial en impulsar la investigación genómica y la innovación agrícola.
El Dr. Zhangjun Fei, codesarrollador de HSE, afirma: “El Motor de Búsqueda de Genomas Hortícolas es un avance fundamental en la genómica hortícola, que proporciona un acceso sin precedentes a datos genómicos amplios. Esta herramienta revoluciona la investigación genómica vegetal, acelerando significativamente los descubrimientos y aplicaciones de mejora de cultivos”.
HSE no solo agiliza la investigación genómica, sino que también impacta profundamente en el mejoramiento de cultivos y la conservación genética. Al simplificar el acceso y el análisis de datos genómicos, HSE permite a los investigadores identificar rápidamente los genes asociados con rasgos deseables, acelerando así el mejoramiento de variedades de cultivos que son más nutritivas, resilientes y compatibles con prácticas agrícolas sostenibles.
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Referencias
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Información de financiación
Este trabajo fue apoyado por subvenciones de la Universidad Agrícola de Beijing (fondo de inicio) a Y.Z., el Programa de Mejora de la Capacidad de Investigación e Innovación de Jóvenes Profesores QJKC2022044 y el Proyecto de Plan de Investigación Científica de la Comisión Municipal de Educación de Beijing KM202310020010 a S.Wang. La potencia de cálculo fue apoyada por Alibaba Cloud.
Acerca de Horticulture Research
Horticulture Research es una revista de acceso abierto de la Universidad Agrícola de Nanjing y ocupa el primer lugar en la categoría de Horticultura de los Informes de Citas de Revistas ™ de Clarivate, 2022. La revista está comprometida a publicar artículos de investigación originales, revisiones, perspectivas, comentarios, artículos de correspondencia y cartas al editor relacionados con todas las plantas hortícolas y disciplinas principales, incluida la biotecnología, el mejoramiento, la biología celular y molecular, la evolución, la genética, las interacciones interespecíficas, la fisiología y el origen y la domesticación de los cultivos.
Journal
Horticulture Research
Asunto de investigación
No aplica
Título del artículo
Motor de búsqueda de genomas hortícolas, un motor de búsqueda genómica universal para cultivos hortícolas
Fecha de publicación del artículo
8 de abril de 2024
Declaración de conflicto de intereses
Los autores declaran que no tienen conflictos de intereses.
